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机器学习在食品霉菌毒素检测中的应用 | MDPI Toxins |
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论文标题:Machine Learning Applied to the Detection of Mycotoxin in Food: A Systematic Review
论文链接:https://www.mdpi.com/2072-6651/16/6/268
期刊名:Toxins
期刊主页:https://www.mdpi.com/journal/toxins
霉菌毒素是由某些真菌产生的有毒次级代谢产物,常见于谷物、坚果、香料、乳制品等食品中,对食品安全和公共健康构成严重威胁。传统检测通过液相色谱-质谱联用、高效液相色谱、ELISA等方法可以准确的检测到霉菌毒素的存在,但这些方法存在耗时长、成本高、对专业设备与人员依赖性高,难以满足大规模筛查的需求。近年来机器学习 (Machine Learning, ML)方法以其高效、低成本、可扩展性强等优点,在霉菌毒素检测领域备受关注。爱尔兰梅努斯大学Alan Inglis博士团队在toxins期刊系统回顾2013–2023年间,ML在霉菌毒素检测中的应用研究,分析不同ML方法的性能、优缺点、数据类型和应用场景,指出当前研究中存在的问题并提出未来的发展方向。

机器学习在食品霉菌毒素检测中的应用:系统综述
机器学习方法
从广义上讲,机器学习方法可以分为三类,即监督学习(Supervised Learning, SL)、无监督学习(Unsupervised Learning, UL) 和强化学习(Reinforcement Learning, RL)。目前在霉菌毒素检测领域,主要采用监督学习和无监督学习方法,其中监督学习(特别是神经网络和随机森林)是主要的检测方法,无监督学习主要用于数据预处理环节。本研究将ML过程整理为为以下五个步骤:
1. 数据收集:该过程从收集原始数据开始,原始数据可以来自许多来源或站点;
2. 数据准备:将收集的原始数据进行分析前的准备,通常涉及清理和格式化数据;
3. 数据拆分:准备好的数据可以拆分为三部分。这些是训练数据、验证数据和测试数据;
4. 模型选择:根据数据类型,选择无监督或监督学习模型;
5. 模型训练、评估和预测:该过程涉及用训练数据训练模型,使用验证数据优化模型的超参数,最后使用测试数据评估其整体性能。

典型的机器学习过程
研究过程与结果
研究团队使用Scopus数据库,关键词包括“mycotoxin”与多种ML相关术语(如神经网络、随机森林、SVM、增强等)。筛选出91篇相关文献并重点分析其中30篇。本研究对于霉菌毒素的研究涵盖玉米、小麦、大麦、花生、燕麦等多种作物,主要检测对象包括黄曲霉毒素、伏马菌素、脱氧雪腐镰刀菌烯醇等,主要基于以下数据类型进行检测与预测:
1. 气象数据(温度、湿度、降雨量等):用于预测霉菌毒素发生风险。
2. 农业管理数据:前茬作物、农药使用、品种选择等。
3. 作物物候与品种数据:不同品种对真菌感染的敏感性不同。
4. 光谱数据(高光谱、多光谱成像):目前最常用的数据类型,适用于非破坏性检测。
5. 电子鼻数据:用于检测挥发性有机物,辅助分类。
分析结果表明目前最常用的方法是神经网络,其次是随机森林、梯度提升、支持向量机和决策树/贝叶斯网络等。

最流行的机器学习方法
• 神经网络(尤其是CNN):擅长图像和非线性建模但是黑箱、计算成本高、易过拟合,对小麦赤霉病的检测准确率接近100%,对花生黄曲霉毒素检测的准确率高于95%;
• 随机森林:鲁棒性强、调参少,但是容易黑箱、不适合极大规模数据,该方法对玉米青贮毒素分类准确率>90%;
• 梯度提升(GBM/XGBoost):预测能力强、支持多种损失函数,但是计算资源消耗大、易过拟合,对玉米黄曲霉毒素预测准确率为96.8%可以大幅降低监测成本。
• 支持向量机:适合小样本、高维数据的分析,存在调参复杂、对核函数敏感的缺点,对小麦赤霉病分类准确率可达到96.5%;
• 决策树/贝叶斯网络:可解释性强、适合处理缺失数据,但是易过拟合(DT)、计算复杂(BN),CART方法检测小麦DON毒素准确率可以达到88–92%。
通过对文献的系统分析,研究团队指出当前ML方法在霉菌毒素检测中仍面临许多挑战。首先由于大多数研究未公开代码或者数据,存在可重复性差的问题。其次由于缺乏标准化,不同研究之间数据、指标、模型配置差异大,难以比较。同时目前的高准确率(>90%)多来自实验室控制环境,真实场景下可能表现不佳,存在潜在过拟合风险。最后高成本设备(如高光谱相机)限制了其实际应用。
因此该领域在未来仍需不断努力提高模型的可解释性,推动开放数据与代码,增强研究的透明度,制定标准化报告流程,统一超参数与性能指标,开展跨模型、跨数据集的系统比较研究,探索低成本检测技术(如多光谱、电子鼻等),降低成本,不断推动其工业应用步伐。
研究总结
机器学习,尤其是神经网络和随机森林方法,在霉菌毒素检测中展现出巨大优势和潜力,检测准确率可以高达90%。然而,当前研究仍处于初期阶段,未来应不断提高研究透明度、推动流程的标准化、降低成本,拓展该领域的实际应用和产业化发展。
Toxins 期刊介绍
主编:Jay Fox, University of Virginia, Charlottesville, USA
期刊主要涵盖了由生物体产生的各类毒素领域的相关研究。
2025 Impact Factor:4.0
2025 CiteScore:8.3
Time to First Decision:18 Days
Acceptance to Publication:3.6 Days
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